生技產業被視為二十一世紀的明星產業，特別是在醫療進步下，不但使整體生活的提升，國人平均壽命增加，更讓健康養生觀念日益重視。而這些有利因素為生技產業帶來美好的發展前景，並成為各方期待的明星產業。
  生技產業具備高經濟效益、高技術性，低污染、低耗能的特性。生物科技產業是相當強調研發創新的產業，研發活動的主要成效表現在新應用技術的產生、產品品質的提升等方面。整體生物技術產業的研發經費支出因相對較其他產業高，故新技術或新產品的研發能力可說是其主要的競爭優勢，但研發期長也造成成本累積，而使公司面臨經營上的風險。
  1997年發生亞洲金融危機後，國內、外相繼爆發不少企業醜聞，不但影響整個經濟環境，更讓投資大眾的權利受損，亦凸顯公司治理對企業管理經營上的重要性。內部控制已深受許多企業廣泛之應用。在現行內部控制的運用下，其對於各控制項目之要求已有明確規範，並對公司運作有極大的幫助與效益。因此，本論文以內部控制五大要素：控制環境、風險評估、控制作業、資訊與溝通、監督來分析個案生技醫藥產業之內部控制機制，希望藉由個案實際運作分析可作為其他生技公司之參考。

The bio-tech industry is viewed as the most potential industry. With the development of medical science, we not only have a better standards of living and a longer life span, but also that we put more emphasis on how to maintain a healthy life style. It is also because of these favorable factors that promise a prosperous future for bio-tech industry and make it a rising-star industry.
  The bio-tech industry features high economic benefit, high technological level, low pollution, and low energy consumption. Innovation is always the priority of this industry. The main outcomes of R&D are the introduction of new application and the enhancement of products’ quality. The R&D expenses in this industry is higher than others industries, therefore the abilities of introducing new technology and developing new products are it’s main competitive edges. However, the long-term accumulation of R&D costs may result in a financial risk for the operation of business.
  After the Asian financial crisis in 97, the outbreak of several business scandals not only has a negative impact on the overall investing environment and the investors, but highlights the importance of corporate governance for the business. Nowadays the idea of internal control is widely adapted by many businesses. This thesis uses the five controlling factors of internal control: controlling environment, risk evaluation, controlling operation, information & communication, and supervision to analyze the mechanism of internal control in bio-tech and pharmaceutical industries. Last but not least, we also hope the case study may offer some hands-on experience for other bio-tech companies.

目錄
第一章 緒論
第一節 研究動機與目的..................1
第二節 研究方法........................4
第三節 研究範圍與限制..................5
第四節 研究流程與架構..................6

第二章 文獻探討
第一節 生技產業........................8
第二節 公司治理........................18
第三節 內部控制........................21

第三章 生技產業內控機制之要素分析
第一節 生技產業之概況..................30
第二節 內部控制對生技產業之重要性......39
第三節 生技產業內部控制機制要素之分析..41
 
第四章 個案公司內控之分析
第一節 個案公司背景....................51
第二節 A公司現行公司治理與內部控制狀況.57
第三節 A公司內部控制五大要素分析.......60

第五章 結論與建議
第一節 結論............................72
第二節 建議............................75
第三節 未來研究方向....................77

參考文獻...............................78

附錄 公開發行公司建立內部控制制度處理原則.84


表目錄
表2-1  生物技術定義之整理表...................10
表2-2  生物技術產業細項產業之應用產品一覽表...11
表2-3  生技產業之特性整理表...................14
表2-4  生技產業關鍵成功之因素.................17
表2-5  公司治理之定義整理表...................20
表2-6  內部控制之定義整理表...................23
表2-7  內部控制處理準則第六條內部控制組成要素表.29
表3-1  2000-2013年全球生技產業各領域市場預測值與趨勢表.30
表3-2  2002-2004年全球生技產業概況............31
表3-3  2004年我國生技產業發展現況.............32
表3-4  2002-2004年新興生技產業概況............33
表3-5  近五年我國生技/醫藥產業之投資額........34
表3-6  2003-2004年我國生技產業研發投資分佈....35
表4-1  A公司主要產品營業比重..................54
表4-2  A公司投入研發比重......................55
表4-3  個案公司內部控制五大要素分析彙總.......71


圖目錄
圖1-1  本研究架構與流程圖......................7
圖2-1  公司治理架構圖..........................19
圖2-2  內部控制制度各組成要素關係圖............25
圖2-3  內部控制制度組成要素與目標及作業活動相互間關係圖..27
圖3-1  2000~2005年我國生技/醫藥產業之投資額變化..34
圖3-2  我國1997-2003年成立生技公司的類別.......36
圖3-3  我國生物技術研究發展之分工合作體系......38
圖3-4  預算控制................................46
圖4-1  A公司組織圖.............................52

一、學術論文
1.牛惠之 (2003)，「生物科技之風險議題之省思與管理」，國立清華大學科技法律研究所，2003年3月10日。
2.王啟光 (1999)，生技製藥產業關鍵成功因素，淡江大學管理科學學系碩士班碩士論文未出版。
3.巫奉炫 (1995)，技術創新管理之案研究-以聯華電子公司為例，交通大學科技管理研究所碩士論文。
4.吳淑鈴 (2004)，生物科技產業智慧資本衡量指標之建立，國立彰化師範大學
計學系碩士論文。
5.吳克府 (2005)，企業建立內控內稽制度之個案研究-以遠東集團為例，東華大學碩士論文。
6.陳昌禮 (2004)，生物科技產業評價創造之效率研究，中國文化大學經濟研究
碩士論文。
7.黃清榮 (2004)，內部控制自行評估關鍵成功因素及其效益之探討-以我國某塑膠公司為例，淡江大學會計學系碩士在職專班論文。
8.梁國棟 (2005)，製藥業企業倫理與執行GMP績效之相關性研究-永信藥品關係企業為例，靜宜大學企業管研究所碩士論文。
9.翁秀芬 (2004)，領導風格及組織文化與企業內部控制制度執行成效關聯性之研究，東吳大學會計學系碩士論文。
10.趙志明 (2004)，人力資本之事工作者管理對創新績效影響之相關性研究-以生物技術產業為例，國立中山大學人力資源管理研究所碩士在職專班論文。
11.廖振谷 (2002)，台灣地區生技與製藥業之相對經營效率動態分析，國立中央大學企業管理研究所碩士論文。
12.劉力仁 (2003)，生技製藥產業評價模式通用性之研究-以台灣上市櫃公司為例，中央大學企業管理研究所碩士論文。
13.戴德賢 (2003)，台灣生技公司財務績效之研究，中國文化大學經濟研究所碩士論文。
14.鍾慧儀 (2003)，我國企業風險管理之研究-以生物科技公司為例，國立高雄第一科技大學風險管理與保險系碩士論文。

二、研究報告
1.朱兆文 (1995)，我國生物技術產業現況與展望，財團法人生技中心。
2.江晃榮 (2006)，「2005年全球生技醫藥品產業發展動向與研發趨勢」，華文生技網，2006年3月7日。
3.李連滋、江淑芬 (1997)，「我國潛在新興產業SWOT分析－以生物技術產業為例」，經濟情勢暨評論季刊第3卷，第3期，頁95-108。
4.牟敦剛 (1996)，「推動我國生物技術及相關產業升級之課題探討」，經濟情勢暨評論季刊第2券，第1期，民國85年5月，頁76-93。
5.呂振隆 (2005)，「企業倫理與風險控制環境」，內部稽核季刊，第51期，頁38-43。 
6.林秀玲 (2002)，「企業e化的重要性」，內部稽核季刊，第40期，頁62-67。
7.邱永仁 (2005)，「台灣生技產業政策與現況卓越講座」，國立高雄大學推廣教育中心，2005年10月4日。
8.邱昰芳 (2006)，「生物技術產業景氣動態報告」，台灣經濟研究院，2006年第一      季，2006年1月19日。 
9.姚祖舜 (2004)，「資訊生技結合搭起國內IT與BT產業溝通平台」，生技時代No.31。
10.財團法人生物技術開發中心 (2000)，2000生物技術產業年鑑。 
11.財團法人生物技術開發中心 (2002)，2002生物技術產業年鑑。
12.秦慶瑤 (2005)，「生技產業期待顯身手」，台灣化學科技產業協進會。
13.秦慶瑤、湯谷清、朱兆文 (2005)，「生技藥品產業趨勢與我國發展機會專題研究報告」。
14.馬秀如(1998)譯，內部控制-整體架構，財團法人中華民國會計研究發展基金會。
15.陳文彬 (2005)，企業內部控制評估，台北：財團法人中華民國證券暨期貨市場發展基金會。
16.黃英家、吳欽彬、羅麗珠 (1999)，「台灣發展醫藥生物技術產業的智慧財產權策略」，1999年全國智慧財產權研討會，交大企法中心。
17.黃仁鴻、林佳燕、黃俊閎(2001)，國家創新體系對我國生技產業發展之影響，中華民國經濟部，2001年6月。
18.葉冠妏、吳素環 (2003)，「強化風險控管 替企業未來作承諾」，資誠會計師聯盟所。
19.經濟部工業局 (2006)，「我國生技產業推動情形」，2006年1月23日。
20.經濟部工業局 (2004)，2004生技產業白皮書。
21.管理雜誌 (2004)，公司治理概念股，第357期，2004年3月號，頁72。
22.廖美智 (2002)，「生物技術產業結構及經營模式分析」，財團法人生物技術開發中心
23.羅淑慧 (2005)，「台灣醫藥之專業化策略專題研究報告」，財團法人生物技術開發中心，2005年12月31日。
24.蘇遠志 (1997)，「台灣生物技術發展之困境與挑戰」，中華民國產業科技發展協進會。

三、專書
1.伍忠賢 (2003)，公司治理的第一本書，台北：商周出版。
2.江晃榮 (2001)，不可思議的生物技術，台北：世茂出版社。
3.林炳滄 (2002)，內部稽核理論與實務，第五版，台北。
4.葉匡時 (2003)，公司治理，台北：天下文化書坊。  
5.葉銀華、柯承恩、李存修 (2002)，公司治理與平等系統，台北：商智文化。
6.劉紹樑 (2002)，從莊子到安隆-A+公司治理，台北：天下雜誌股份有限公司。

 四、英文書目
1﹒Alkhafaji, A.F.(1989).Global Marketing News. Journal of Global Marketing, 3(2), p.17-124.
2﹒Wioceshyn, J. (1995) ‘Lessons in product innovation: A case study of biotechnology firms’, R&D management., Vol.25, p395-405.
3﹒Mcleod, R. Jr.,(1990) Management Information System, New York: Macmillan Publishing Company. 
4﹒Roberts, E.B. and Mizouchi, R.(1989), ‘Inter-Firm Technological Collaboration：The case of Japanese Biotechnology ’International Journal of Technology Management, Vol.4(1), p.43-61.　
5﹒Shleifer, A. and Vishny, R. W.,(1997) ‘A survery of corporate Governance’ The Journal of Finance, Vol.7, p737-783.
6﹒Spalding B.J(1986) How biotechnology is Faring as and Industry, Chemical week, 139(23), p9-13.
7﹒Thorelli, H. B.(1986), Network: Between Markets and Hierarchies, Strategic Management Journal, 7, p37-51.

五、網站資料
1、公開資訊觀測站  http://newmops.tse.com.tw
2、行政院衛生署  http://www.nlfd.gov.tw 
3、行政院金融監督管理委員會證期局  http://www.sfb.gov.tw
4、台灣化學科技產業協進會  http://www.twcia.org.tw
5、財團法人生物技術開發中心  http://www.dcb.org.tw
6、經濟部工業局  http://www.moeaidb.gov.tw
7、華文生技網  bioweb.com.tw
8、資誠會計師事務所全球聯盟所  http：//friends.pwcglobal.com.tw
9、台灣經濟研究院 http://www.tie.tier.org.tw
10、中華民國經濟部http://www.moea.gov.tw/~ecobook/season 
11、中華民國內部稽核協會 http://www.iia.org.tw/main/main.HTM