抗菌胜肽擁有廣效的抗菌活性，像是對抗細菌、真菌及病毒等，其抗菌活性與結構參數擁有密切的關係。但是目前並無明確表示結構參數與抗菌活性之關係，因為當置換胺基酸時，不僅改變疏水性或電荷，可能也改變疏水力矩、極性角度和螺旋。所以本研究將MPB及其衍生物的結構參數與抗菌活性之關係進行統計歸納，探討彼此間的關係，另外設計MPB-W13，以改變疏水性為重點，增加胜肽尾端的疏水性，並期望能增加π-π interaction，使尾端更穩定，且增加抗菌活性。
根據所進行的MPB-W13實驗之結果與MPB及其衍生物的結構參數與抗菌活性之關係，本研究驗證了以下幾點結構參數與抗菌活性之關係：（1）抗菌胜肽的疏水性大，抗菌效果較好，而N端與C端的疏水性也與抗菌活性有關係，當疏水性愈大，抗菌效果較佳，但是疏水性太大可能影響到抗菌胜肽聚集行為，導致長時間抗菌效果較差，（2）置換的胺基酸會影響抗菌胜肽的兩親性，其中發現兩親性的疏水區域愈大，抗菌效果愈好，而親水區域愈大，抗菌效果愈差。
另外，從MPB-W13的最佳化結構中，我們發現到W9和W13的芳香環側鏈並未形成π-π interaction，但是MPB-W13的螺旋含量最高。可能由於W13與L14之間的疏水作用，影響螺旋結構的穩定，並可能進而導致抗菌活性受到影響。

Most antimicrobial peptides show a wide spectrum of activity against bacteria, fungi and viruses. Their structural parameters are closely related with antimicrobial activity. However, the relationship between structural parameters and antimicrobial activity is still not vary clear. This research explored the relationship between structural parameters and antimicrobial activity of MPB and its analogues. We designed MPB-W13 (LKLKSIVSWAKKWL-NH2) to increase the hydrophobicity and expected to add a π-π interaction that may make the C terminal more stable to increase antimicrobial activity.
  According to the results of MPB-W13 and the relationship between structural parameters and antimicrobial activity of MPB and its analogues, the following results were obtained: (1) The higher overall hydrophobicity of antimicrobial peptides may increase antimicrobial activity, but an optimized hydrophobicity is exist. The N-local hydrophobicity and the C-local hydrophobicity are also closely related with antimicrobial activity. The higher local hydrophobicity may increase the antimicrobial activity. (2) The substituted amino acid may affect the amphiphilicity. We found a larger hydrophobic region in amphiphilicity increase antimicrobial activity and a larger hydrophilic region in amphiphilicity decrease antimicrobial activity.
  Additionally, we didn’t find the π-π interaction between W9 and W13. However, the experimental results showed W13 could have hydrophobic interaction with L14. It revealed that the 13th amino acid may affect the structural stability of C terminal of MPB-W13 and led antimicrobial activity to change.

目錄	I
圖目錄	V
表目錄	XI
縮寫表	XIII
第1章	緒論	1
1.1	抗菌胜肽（Antimicrobial peptides, AMPs）	1
1.2	抗菌作用的機制	2
1.3	結構參數	4
1.3.1	電荷（Charge, C）	5
1.3.2	疏水性（Hydrophobicity, H）	5
1.3.3	疏水力矩（Hydrophobic Moment, μH）	7
1.3.4	螺旋性（Helicity）	8
1.3.5	極性角度（Polar Angle）	9
1.4	Mastoparan家族（MP家族）	10
1.5	Mastoparan-B（MPB）	11
1.5.1	MPB及其衍生物的生物活性之研究	12
1.6	抗菌胜肽文獻回顧	13
1.7	研究動機與目的	14
第2章	實驗	15
2.1	固相胜肽合成（Solid-Phase Peptide Synthesis, SPPS）	15
2.1.1	固相胜肽合成方法與材料	18
2.1.2	胜肽純化方法與材料	20
2.2	圓二色性（Circular Dichroism）	21
2.2.1	圓二色光譜實驗方法與材料	25
2.3	核磁共振（Nuclear Magnetic Resonance, NMR）	26
2.3.1	核磁共振實驗方法與材料	31
2.4	二維核磁共振（Two-Dimensional Nuclear Magnetic Resonance, 2D-NMR）	32
2.4.1	TOCSY（Total Correlation Spectroscopy）	33
2.4.2	NOESY（Nuclear Overhauser Enhancement Spectros-copy）	34
2.4.3	HSQC（Heteronuclear Single Quantum Coherence Spec-troscopy）	37
2.4.4	二維核磁共振實驗條件	38
2.5	二次化學位移（Secondary Chemical Shift）	39
2.6	XPLOR 結構計算	42
2.6.1	XPLOR 結構計算方法	43
2.7	蛋白質動力學	47
2.7.1	與模型無關（Model-free）	48
2.7.2	函數模型選擇（Model Selection）	49
2.7.3	與模型無關方法（Model-free Method）計算方法	51
2.8	抗菌活性（Antimicrobial Activity）	54
2.8.1	生長抑菌率	55
2.8.2	劑量反應曲線（Dose-Response Curves）	55
2.8.3	抗菌活性方法與材料	58
2.9	實驗流程圖	59
2.10	實驗儀器	60
第3章	結果與討論	61
3.1	MPB及其衍生物的結構參數與抗菌活性之關係	61
3.2	胜肽純化與分子量測量	68
3.3	CD光譜	69
3.4	NMR光譜	73
3.4.1	TOCSY光譜	73
3.4.2	NOESY光譜	75
3.4.3	HSQC光譜	88
3.5	二次化學位移	91
3.6	結構計算	92
3.7	動態行為	99
3.8	抗菌活性	103
3.9	MPB-W13的結構參數與抗菌活性之關係	106
第4章	結論	109
參考資料	111

圖目錄
圖 1-1抗菌胜肽的二級結構圖，（A）α螺旋（α-helical）結構，（B）β摺疊（β-sheet）結構，（C）延展（Extend）結構，（D）迴圈（Loop）結構。	2
圖 1-2抗菌胜肽作用機制，（A）桶狀穿孔式（Barrel-Stave mode），（B）地毯式（Carpet mode），（C）環狀穿孔式（Toroidal pore mode），藍色代表疏水性胺基酸，紅色代表親水性胺基酸。	3
圖 1-3 Magainin-2 呈兩親性α螺旋結構示意圖。	8
圖 1-4 Magainin-2的螺旋投影圖，以Φ表示極性角度。	9
圖 1-5 MPB最佳化結構，紅色表示疏水性胺基酸，藍色表示親水性胺基酸，彩帶範圍表示螺旋範圍為K4-V13。	11
圖 2-1（A）Rink Amide Resin含有Fmoc保護基，（B）Wang Resin。	15
圖 2-2（A）Fmoc-Lys(Boc)-OH，（B）Fmoc-Ser(tBu)-OH，（C）Fmoc-Trp(Boc)-OH。	16
圖 2-3 Ninhydrin法。	17
圖 2-4電磁波偏振示意圖。	21
圖 2-5（A）圓形偏振光，（B）橢圓偏振光。	22
圖 2-6蛋白質二級結構，α-helical結構（實線）、Anti-parallel β-sheet結構（粗虛線）、Type I β-turn結構（點線）、Poly (Pro) II helix結構（折線）和Random coil結構（細虛線）。	23
圖 2-7（A）在B0下磁偶極矩的進動與磁化量示意圖，（B）當受到B1時磁化量偏轉示意圖。	27
圖 2-8氫原子核在靜磁場中所產生的能階分裂示意圖。	28
圖 2-9縱向弛緩示意圖，經過時間τ後，磁化量從-Z軸回到Z軸，其Peak訊號可作為磁化量強度，求得T1。	29
圖 2-10縱向弛緩與時間關係圖。	30
圖 2-11橫向弛緩與時間關係圖。	31
圖 2-12二維核磁共振的脈衝序列。	32
圖 2-13 TOCSY的脈衝序列。	34
圖 2-14雙自旋系統的能階躍遷情形。	35
圖 2-15 NOESY的脈衝序列。	35
圖 2-16相鄰胺基酸質子間的NOE訊號連結。	36
圖 2-17常見二級結構的NOE訊號連結。	36
圖 2-18 HSQC的脈衝序列。	37
圖 2-19分子整體與局部運動之示意圖。	49
圖 2-20理想的劑量反應曲線。	57
圖 3-1 MPB衍生物的RP HPLC層析圖。	68
圖 3-2 MPB-W13在298 K中，不同TFE濃度的CD光譜疊圖。	70
圖 3-3 MPB-W13在30% TFE溶液中，不同溫度的CD光譜疊圖。	71
圖 3-4 MPB衍生物在298 K 30% TFE溶液中的CD光譜疊圖。	72
圖 3-5 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的TOCSY光譜，顯示Leu3、Lys4、Ser5、Ile6、Val7、Ser8、Trp9、Ala10、Lys11、Lys12、Trp13及Leu14垂直連結NH至各個質子的交叉峰。	73
圖 3-6 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的NOESY光譜，顯示dαN (i, i+1)的NOE連結。	76
圖 3-7 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的NOESY光譜，顯示dβN (i, i+1)的NOE連結。	77
圖 3-8 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的NOESY光譜，顯示dNN (i, i+1)的NOE連結。	78
圖 3-9 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的NOESY光譜，顯示dαN (i, i+3)、dαN (i, i+4)的NOE連結。	79
圖 3-10 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的NOESY光譜，顯示的dγN (i, i+1)、dγN (i, i+4)NOE連結。	80
圖 3-11 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的NOESY光譜，顯示dαβ (i, i+3)的NOE連結。	81
圖 3-12 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的NOESY光譜，顯示dαγ (i, i+3)的NOE連結。	82
圖 3-13 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的NOESY光譜，顯示Trp9側鏈芳香環的NOE連結。	83
圖 3-14 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的NOESY光譜，顯示Trp13側鏈芳香環的NOE連結。	84
圖 3-15 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的NOESY光譜，顯示C端末端修飾的-NH2的NOE連結。	85
圖 3-16 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的NOESY光譜，顯示Trp9側鏈芳香環和C端末端修飾-NH2的NOE連結。	86
圖 3-17 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的NOE訊號連結，用線的粗細分別來表示強、中、弱的NOE訊號。	87
圖 3-18 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的1H-13C HSQC光譜，縱向弛緩。	88
圖 3-19 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的1H-13C HSQC光譜，橫向弛緩。	89
圖 3-20 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的1H-13C HSQC光譜，交叉弛緩。	90
圖 3-21 MPB-W13 αCH的二次化學位移圖。	91
圖 3-22 MPB-W13 αC的二次化學位移圖。	91
圖 3-23 MPB-W13的20個最低能量結構疊圖，顯示Backbone。	94
圖 3-24 MPB-W13的20個最低能量結構疊圖，彩帶區域表示螺旋區域為K4-W13。	94
圖 3-25 MPB-W13最低能量結構的親水面積與疏水面積分佈，藍色為親水面積，紅色為疏水面積。	94
圖 3-26 MPB-W13 20個最低能量結構的Ramachandran Plot。	95
圖 3-27 MPB最低能量結構，彩帶區域表示螺旋區域為K4-V13。	95
圖 3-28 MPB最低能量結構的親水面積與疏水面積分佈，藍色為親水面積，紅色為疏水面積。	96
圖 3-29 MPB-A13最低能量結構，彩帶區域表示螺旋區域為K4-A13。	96
圖 3-30 MPB-A13最低能量結構的親水面積與疏水面積分佈，藍色為親水面積，紅色為疏水面積。	96
圖 3-31 MPB衍生物的螺旋投影圖，（A）MPB-W13，（B）MPB，（C）MPB-A13，紅色圓圈內的胺基酸為疏水性，藍色圓圈內的胺基酸為親水性，無圓圈的胺基酸表示未在螺旋範圍內，藍色圓形表示帶正電荷胺基酸。	97
圖 3-32 MPB-W13側鏈的示意圖，藍色面積表示Tryptophan的芳香環側鏈。	98
圖 3-33 MPB-W13 S2與NOE數目的統計。	102
圖 3-34 MPB衍生物S2與NOE數目的統計。	102
圖 3-35不同MPB-W13濃度在不同時間下抗菌結果的O. D.值。	103
圖 3-36 MPB-W13在不同抗菌時間下的劑量反應曲線。	104

表目錄
表 1-1胺基酸側鏈的疏水值。	6
表 1-2 Mastoparan家族的胺基酸序列。	10
表 2-1固相胜肽合成實驗藥品。	19
表 2-2 RP HPLC純化胜肽實驗藥品。	20
表 2-3圓二色光譜的二級結構之吸收波長。	24
表 2-4圓二色光譜實驗藥品。	25
表 2-5核磁共振常觀察的原子核。	27
表 2-6 核磁共振實驗藥品。	31
表 2-7 TOCSY和NOESY實驗的參數設定。	38
表 2-8 HSQC實驗的參數設定。	38
表 2-9 T1和T2 Relaxation Delay Time。	38
表 2-10 αCH無序纏繞時的化學位移。	41
表 2-11 αC、CO和βC無序纏繞時的化學位移。	41
表 2-12 mfiuput變數。	52
表 2-13抗菌活性實驗藥品。	58
表 3-1 MPB衍生物序列。	64
表 3-2 MPB衍生物的淨電荷（Net Charge）、N端電荷（N-local C）和C端電荷（C-local C）統計，N/A表明文獻中未提及數值。	65
表 3-3 MPB衍生物的整體疏水性（H）、N端疏水性（N-local H）和C端疏水性（C-local H）統計，N/A表明文獻中未提及數值。	66
表 3-4 MPB衍生物的疏水力矩（μH）、極性角度（Polar Angle）和螺旋性（Helicity）統計，N/A表明文獻中未提及數值。	67
表 3-5 MPB-W13在298 K下，不同TFE濃度的螺旋含量。	70
表 3-6 MPB-W13在30% TFE溶液中，不同溫度的螺旋含量。	71
表 3-7 MPB-W13在298 K 30% TFE-d3/ 10% D2O/ 60% H2O下的1H化學位移表，N/A表明光譜中未顯示。	74
表 3-8 MPB-W13 20個最低能量結構的NOE和RMSD統計。	92
表 3-9 MPB-W13弛緩實驗參數和S2，N/A表明光譜中未顯示。	101
表 3-10 MPB衍生物之τm和S2。	102
表 3-11 MPB衍生物在不同時間下的抗菌活性（IC50）。	105
表 3-12 MPB、MPB-W13和MPB-A13的整體疏水性（H）、N端疏水性（N-local H）和C端疏水性（C-local H）統計。	108
表 3-13 MPB、MPB-W13和MPB-A13的疏水力矩（μH）、極性角度（Polar Angle）和螺旋性（Helicity）統計。	108

[1]	Bahar A. A., Ren D. Antimicrobial Peptides. Pharmaceuticals 2013, 6(12), 1543–1575.
[2]	Thennarasu S., Lee D. K., Tan A., Prasad Kari U., Ramamoorthy A. Antimicrobial activity and membrane selective interactions of a synthetic lipopeptide MSI-843. Biochim Biophys Acta. 2005, 1711(1), 49-58.
[3]	Syvitski R. T., Burton I., Mattatall N. R., Douglas S. E., Jakeman D. L. Structural characterization of the antimicrobial peptide pleurocidin from winter flounder. Biochemistry 2005, 44(19), 7282-7293.
[4]	Peters B. M., Shirtliff M. E., Jabra-Rizk M. A. Antimicrobial Peptides: Primeval Molecules or Future Drugs? PLoS Pathog 2010, 6(10), e1001067.
[5]	Hancock R. E. Cationic peptides: effectors in innate immunity and novel antimicrobials. Lancet Infect Dis. 2001, 1(3), 156-64.
[6]	Myers J. K., Pace C. N., Scholtz J. M. Trifluoroethanol effects on helix propensity and electrostatic interactions in the helical peptide from ribonuclease T1. Protein Sci. 1998, 7(2), 383-8.
[7]	Zhang L., Rozek A., Hancock R. E. Interaction of cationic antimicrobial peptides with model membranes. J Biol Chem. 2001, 276(38), 35714-22.
[8]	Pouny Y., Rapaport D., Mor A., Nicolas P., Shai Y. Interaction of antimicrobial dermaseptin and its fluorescently labeled analogs with phospholipid membranes. Biochemistry 1992, 31(49), 12416-12423.
[9]	Matsuzaki K, Murase O, Fujii N, Miyajima K. An antimicrobial peptide, magainin 2, induced rapid flip-flop of phospholipids coupled with pore formation and peptide translocation. Biochemistry 1996, 35(35), 11361-8.
[10]	Wu M, Maier E, Benz R, Hancock RE. Mechanism of interaction of different classes of cationic antimicrobial peptides with planar bilayers and with the cytoplasmic membrane of Escherichia coli. Biochemistry 1999, 38(22), 7235-42.
[11]	Yeaman M. R., Yount N. Y.  Mechanisms of antimicrobial peptide action and resistance. Pharmacol Rev. 2003, 55(1), 27-55.
[12]	Mileykovskaya E., Sun Q., Margolin W., Dowhan W. Localization and function of early cell division proteins in filamentous Escherichia coli cells lacking phosphatidylethanolamine. J Bacteriol. 1998, 180(16), 4252-7.
[13]	Jiang Z., Vasil A. I., Hale J. D., Hancock R. E., Vasil M. L., Hodges R. S. Effects of net charge and the number of positively charged residues on the biological activity of amphipathic α-helical cationic antimicrobial peptides. Biopolymers. 2008, 90(3), 369-83.
[14]	Chou, H. T., Kuo, T. Y., Chiang, J. C. Design and synthesis of cationic antimicrobial peptides with improved activity and selectivity against Vibrio spp. J. Antimicrob. Agents 2008, 32(2), 130-138.
[15]	Torsten, W., Margitta, D., Richard, M. E. Influence of the angle subtended by the positively charged helix face on the membrane activity of amphipathic antibacterial peptides. Biochemistry 1997, 36 (42), 12869-12880.
[16]	Fauchere J., Pliska V. Hydrophobic parameters II of amino acid side-chains from the partitioning of N-acetyl-amino acid amides. Eur. J. Med. Chem. 1983, 18(4), 369-375.
[17]	Lee D. G., Kim H. N., Park Y. K., Kim H. K., Choi, B. H., Choi C. H., Hahm K. S. Design of novel analogue peptides with potent antibiotic activity based on the antimicrobial peptide, HP (2–20), derived from N-terminus of Helicobacter pylori ribosomal protein L1. Biochim. Biophys. Acta 2002, 1598 (1-2), 185–194.
[18]	Kustanovich I., Shalev D. E., Mikhlin M., Gaidukov L., Mor A. Structural requirements for potent versus selective cytotoxicity for antimicrobial dermaseptin S4 derivatives. J. Biol. Chem. 2002, 277(19), 16941–16951.
[19]	Zelezetsky I., Pacor S., Pag U., Papo N., Shai Y., Sahl H. G., Tossi A. Controlled alteration of the shape and conformational stability of α-helical cell-lytic peptides: effect on mode of action and cell specificity. Biochem. J. 2005, 390(1), 177–188.
[20]	Eisenberg D., Weiss R. M., Terwilliger T. C. The helical hydrophobic moment: a measure of the amphiphilicity of a helix. Nature 1982, 299(5881), 371-374.
[21]	Eisenberg D., Weiss R. M., Terwilliger T. C. The hydrophobic moment detects periodicity in protein hydrophobicity. Proc. Natl. Acad. Sci. 1984, 81(1), 140-144.
[22]	Fernandez-Vidal M., Jayasinghe S., Ladokhin A. S., White S. H. Folding amphipathic helices into membranes: amphiphilicity trumps hydrophobicity. J. Mol. Biol. 2007, 370(3), 459–470.
[23]	Margitta D., Torsten W. Structural features of helical antimicrobial peptides: their potential to modulate activity on model membranes and biological cells. Biochim Biophys Acta 1999, 1462(1), 71-87.
[24]	Kiyota T., Lee S., Sugihara G. Design and synthesis of amphiphilic α-helical model peptides with systematically varied hydrophobic-hydrophilic balance and their interaction with lipid- and bio-membranes. Biochemistry 1996, 35(40), 13196-13204.
[25]	Epand R. M., Vogel H. J. Diversity of antimicrobial peptides and their mechanisms of action. Biochim Biophys Acta. 1999, 1462(1-2), 11-28.
[26]	Huang Y. B., Huang J. F., Chen Y. X. Alpha-helical cationic antimicrobial peptides: relationships of structure and function. Protein Cell 2010, 1(2), 143–152.
[27]	Jenssen H., Hamill P., Hancock R. E. Peptide antimicrobial agents. Clin. Microbiol. Rev. 2006, 19(3), 491–511.
[28]	Pace C.N., Scholtz J. M. A helix propensity scale based on experimental studies of peptides and proteins. Biophys. J. 1998, 75(1), 422–427.
[29]	Brasseur R. Differentiation of lipid-associating helices by use of three-dimensional molecular hydrophobicity potential calculations. J. Biol. Chem. 1991, 266, 16120-16127.
[30]	Brasseur R., Pillot T., Lins L., Vandekerckhove J., Rosseneu M. Peptides in membranes: tipping the balance of membrane stability.  Trends Biochem Sci. 1997, 22(5), 167-71.
[31]	Dathe M., Wieprecht T. Hydrophobicity, hydrophobic moment and angle subtended by charged residues modulate antibacterial and haemolytic activity of amphipathic helical peptides. FEBS Lett. 1997, 403, 208-212.
[32]	Lin C. H.,Shyu C. L.,Kuo Y. M., Tu W. C. A novel anti-microbial peptide isolated from the venom of Vespa affinis. 台灣昆蟲特刊 2006, 8, 33-41.
[33]	Murata K., Shinada T., Ohfune Y., Hisada M., Yasuda A., Naoki H., Nakajima T. Novel mastoparan and protonectin analogs isolated from a solitary wasp, Orancistrocerus drewseni drewseni. Amino Acids. 2009, 37(2), 389-94.
[34]	Higashijima T., Wakamatsu K., Takemitsu M., Fujino M., Nakajima T., Miyazawa T. Conformational change of mastoparan from wasp venom on binding with phospholipid membrane. FEBS Lett. 1983, 152(2), 227-30.
[35]	Ho C. L., Hwang L. L. Structure and biological activities of a new mastoparan isolated from the venom of the hornet Vespa basalis. J. Biochem. 1991, 274(2), 453-456.
[36]	Ho C. L., Lin Y. L., Chen W. C. Immunogenicity of mastoparan B, a cationic tetradecapeptide isolated from the hornet (Vespa basalis) venom, and its structural requirements. Toxicon 1995, 33(11), 1443-1451.
[37]	Ho C. L., Lin Y. L., Chen W. C. Structural requirements for the edema-inducing and hemolytic activities of mastoparan B isolated from the hornet (Vespa basalis) venom. Toxicon 1996, 34(9), 1027-1035.
[38]	Park N. G., Seo J. K., Ku H. J., Lee S.,Sugilhara G., Kim K. H., Park J. S., Kang S. W. Conformation and biologicalactivity of mastoparan B and its analogs I. Bull. Korean Chem. Soc. 1997, 18(1), 933-938.
[39]	Yu K., Kang S., Park N., Shin J., Kim Y. Relationship between the tertiary structures of mastoparan B and its analogs and their lytic activities studied by NMR spectroscopy. J Pept Res. 2000, 55(1), 51-62.
[40]	Yang M. J., Lin W. Y., Lu K. H., Tu W. C. Evaluating antioxidative activities of amino acid substitutions on mastoparan-B. Peptides. 2011, 32(10), 2037-43.
[41]	Da Silva A. V., De Souza B. M., Dos Santos Cabrera M. P., Dias N. B., Gomes P. C., Neto J. R., Stabeli R. G., Palma M. S. The effects of the C-terminal amidation of mastoparans on their biological actions and interactions with membrane-mimetic systems. Biochim Biophys Acta. 2014, 1838(10), 2357-68.
[42]	Chan D. I., Prenner E. J., Vogel H. J. Tryptophan- and arginine-rich antimicrobial peptides: Structures and mechanisms of action. Biochimica et Biophysica Acta 2006, 1758(9), 1184-1202.
[43]	Haney E. F., Nguyen L. T., Schibli D. J., Vogel H. J. Design of a novel tryptophan-rich membrane-active antimicrobial peptide from the membrane-proximal region of the HIV glycoprotein, gp41. Beilstein J Org Chem. 2012, 8, 1172-84.
[44]	Blondelle S. E., Simpkins L. R., Pérez-Payá E., Houghten R. A. Influence of tryptophan residues on melittin's hemolytic activity. Biochim Biophys Acta. 1993, 1202(2), 331-6.
[45]	Lanzarotti E., Biekofsky R. R., Estrin D. A., Marti M. A., Turjanski A. G. Aromatic-aromatic interactions in proteins: beyond the dimer. J Chem Inf Model. 2011, 51(7), 1623-33.
[46]	Shi Z., Olson C. A., Kallenbach N. R. Cation-π interaction in model α-helical peptides. J Am Chem Soc. 2002, 124(13), 3284-91.
[47]	Park S. C., Kim M. H., Hossain M. A., Shin S. Y., Kim Y., Stella L., Wade J. D., Park Y., Hahm K.S. Amphipathic α-helical peptide, HP (2-20), and its analogues derived from Helicobacter pylori: pore formation mechanism in various lipid compositions. Biochim Biophys Acta. 2008, 1778(1), 229-41.
[48]	Merrifield R. B. Solid phase peptide synthesis. I. The synthesis of a tetrapeptide. J. Am. Chem. Soc. 1963, 85(14), 2149-2154.
[49]	Mierke D. F., Dürr H., Kessler H., Jung G. Neuropeptide Y. Optimized solid-phase synthesis and conformational analysis in trifluoroethanol. Eur. J. Biochem. 1992, 206(1), 39-48.
[50]	Carpino L. A., Han G. Y. 9-Fluorenylmethoxycarbonyl amino-protecting group. J. Org. Chem. 1972, 37 (22), 3404–3409.
[51]	Fasman G. D. Circular Dichroism and the Conformational Analysis of Biomolecules. Plenum Press, 1996.
[52]	Halliday D., Resnick R., Walker J. Fundamentals of Physics. John Wiley & Sons Inc., 2013.
[53]	Kelly S. M., Jess T. J., Price N. C. How to study proteins by circular dichroism. Biochim. Biophys. Acta 2005, 1751(2), 119-139.
[54]	Daniel H. A., Ramos H. I. The use of circular dichroism spectroscopy to study protein folding, form and function. J. Biochem. 2009, 3(5), 164-173.
[55]	Luo P., Baldwin R. L. Mechanism of helix induction by trifluoroethanol: a framework for extrapolating the helix-forming properties of peptides from trifluoroethanol/water mixtures back to water. Biochemistry. 1997, 8, 36(27), 8413-21.
[56]	Keeler J. Understanding NMR Spectroscopy. John Wiley & Sons Inc., 2010.
[57]	Cavanagh J., Fairbrother W. J., Arthur G. P. I., Skelton N. J. Protein NMR spectroscopy: Principles and Practice. Academic Press, 1996.
[58]	Wishart D. S., Sykes B. D., Richards F. M. The chemical shift index: a fast and simple method for the assignment of protein secondary structure through NMR spectroscopy. Biochemistry 1992, 31(6), 1647-1651.
[59]	Wishart D. S., Sykes B. D. The 13C chemical-shift index: A simple method for the identification of protein secondary structure using 13C chemical-shift data. J. Biomol. NMR. 1994, 4(2), 171-180.
[60]	Brünger A. T. X-PLOR: version 3.1 : a system for X-ray crystallography and NMR. Yale University Press. USA. 1992.
[61]	Abragam A. The principles of nuclear magnetism. Clarendon Press, 1961.
[62]	Lipari G., Szabo A. Model-free approach to the interpretation of nuclear magnetic resonance relaxation in macromolecules. 1. Theory and range of validity. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104(17), 4546–4559.
[63]	Lipari G., Szabo A. Model-free approach to the interpretation of nuclear magnetic resonance relaxation in macromolecules. 2. Analysis of experimental results. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104(17), 4559–4570.
[64]	Yang D., Chertov O., Oppenheim J. J. The role of mammalian antimicrobial peptides and proteins in awakening of innate host defenses and adaptive immunity. Cell Mol Life Sci. 2001, 58(7), 978-89.
[65]	Dowhan W., Mileykovskaya E., Bogdanov M. Diversity and versatility of lipid-protein interactions revealed by molecular genetic approaches. Biochim Biophys Acta. 2004, 1666(1-2), 19-39.
[66]	Takei N., Takahashi N., Takayanagi T., Ikeda A., Hashimoto K., Takagi M., Hamada T., Saitoh E., Ochiai A., Tanaka T., Taniguchi M. Antimicrobial activity and mechanism of action of a novel cationic α-helical dodecapeptide, a partial sequence of cyanate lyase from rice. Peptides. 2013, 42, 55-62.
[67]	Rautenbach M., Gerstner G. D., Vlok N. M. Analyses of dose-response curves to compare the antimicrobial activity of model cationic α-helical peptides highlights the necessity for a minimum of two activity parameters. Anal. Biochem. 2006, 350(1), 81-90.
[68]	Hong S. Y., Park T. G., Lee K. H. The effect of charge increase on the specificity and activity of a short antimicrobial peptide. Peptides. 2001, 22(10), 1669-74.	
[69]	Slupsky C. M., Spyracopoulos L., Booth V. K., Sykes B. D., Crump M. P. Probing nascent structures in peptides using natural abundance 13C NMR relaxation and reduced spectral density mapping. Proteins. 2007, 67(1), 18-30.
[70]	Yushmanov V. E., Mandal P. K., Liu Z., Tang P., Xu Y. NMR structure and backbone dynamics of the extended second transmembrane domain of the human neuronal glycine receptor α1 subunit.	Biochemistry. 2003, 42(13), 3989-95.
[71]	Li X., Li Y., Peterkofsky A., Wang G. NMR studies of aurein 1.2 analogs. Biochim Biophys Acta. 2006, 1758(9), 1203-14.
[72]	黃詩娟，「利用CD與NMR研究Mastoparan-B在TFE與SDS溶液中的結構與動力學行為」，淡江大學化學學系碩士論文，2011年。
[73]	張馨如，「利用NMR探討Mastoparan-B衍生物的結構、活性與動力學行為」，淡江大學化學學系碩士論文，2011年。
[74]	童偉誠，「利用CD與NMR研究Mastoparan-B衍生物的結構、活性與動力學行為」，淡江大學化學學系碩士論文，2012年。
[75]	林夆羲，「芳香環對抗菌胜肽Mastoparan-B及其衍生物的結構與活性的影響：NMR及CD的研究」，淡江大學化學學系碩士論文，2012年。
[76]	彭安邦，「C端胺化與未胺化修飾的Mastoparan-B衍生物的結構、動力學與活性的關係」，淡江大學化學學系碩士論文，2013年。
[77]	曾雅琳，「C末端殘基如何改變兩親性抗菌胜肽的螺旋摺疊和其抗菌活性：CD和NMR的研究」，淡江大學化學學系碩士論文，2014年。
[78]	朱學桂，「抗菌胜肽Mastoparan-B 9 號位置殘基色胺酸，對結構、動力學和活性的影響」，淡江大學化學學系碩士論文，2014年。
[79]	劉依婷，「極性角度間的電荷分佈對兩親性抗菌胜肽活性的影響」，淡江大學化學學系碩士論文，2014年。